Fragmento restrição
- Criado por
- Renato Passos, Eng. de Software
- Revisado por
- Renato Passos, Eng. de Software
Última atualização: 18 de abr. de 2026
Fórmula
|site2 - site1|
Sobre esta calculadora
Esta calculadora serve para determinar o tamanho de fragmentos de DNA gerados por uma digestão com enzimas de restrição. Ao inserir os valores numéricos que representam a posição de dois sítios de corte no genoma, a ferramenta calcula a distância entre eles, fornecendo o tamanho do fragmento em pares de bases.
O cálculo baseia‑se na diferença absoluta entre as coordenadas dos sítios. A fórmula é |site2, site1|, onde site1 e site2 são a posição do primeiro e do segundo sítio, respectivamente. Esse método garante que o resultado seja sempre positivo, independentemente da ordem dos sítios inseridos.
Use esta calculadora quando precisar estimar fragmentos para projetos de clonagem, mapeamento genômico ou análise de padrões de corte de enzimas. Ela é útil em laboratórios que precisam planejar vetores, validar sequências ou prever resultados de digestões em experimentos de biologia molecular.
Cuidado com sítios que se sobrepõem, variações de sequência que alteram a presença da enzima, ou com cortes que ocorrem no mesmo local. Além disso, verifique se a posição de cada sítio está correta em relação ao referencial usado, pois erros de coordenada geram fragmentos incorretos.
Perguntas frequentes
O que faço se a enzima de restrição tem múltiplos sítios na mesma molécula?
Insira as coordenadas de cada par de sítios que deseja analisar. A calculadora retorna o tamanho de fragmento para cada intervalo, permitindo comparar diferentes cortes.
O que acontece se os sítios inseridos forem iguais?
A diferença absoluta será zero, indicando que não há fragmento entre esses pontos; isso pode indicar um erro de digitação ou que os sítios coincidem.
Como lidar com mutações que alteram a sequência de reconhecimento?
Atualize as coordenadas de acordo com a sequência modificada antes de usar a calculadora, pois a presença ou ausência de um sítio afeta o tamanho final do fragmento.
Posso usar esta ferramenta para fragmentos de RNA?
Sim, desde que você tenha as posições numéricas corretas de cortes em RNA, embora a maioria das enzimas de restrição atue em DNA.
A calculadora considera cortes de enzimas de restrição que deixam pontas 5’ ou 3’?
Não, apenas calcula a distância entre os sítios. Se precisar considerar pontas, ajuste manualmente o tamanho do fragmento de acordo com o protocolo da enzima.